7 Multiples Testen

Multiples Testen

In der Tabelle sind die Werte für 4 Gene dargestellt. Insgesamt wurden 5000 Gene untersucht.

• K1-3 stellen die Kontrollen dar.
  
• T1-3 die getesteten mit dem NAT8L knock-out.
• Der fold change stellt das Verhältnis von knock-out und Kontrolle dar → Hoch oder runter regulierte Gene.
• Die Ergebnisse sind nicht gut vergleichbar, da sie teilweise eine große Streuung zeigen.

Gen	K1	K2	K3	T1	T2	T3	[math]\displaystyle{ \overline{X} }[/math] Kontrolle	[math]\displaystyle{ \overline{X} }[/math] -NAT8L	fold change	p-Wert	pi-Wert
NAT8L	340	348	350	2	0	4	340	2	0,0058	1,00 x [math]\displaystyle{ 10^{-5} }[/math]	0,05
LDH	57	68	34	112	128	105	59,7	115	1,93	0,0043	21,5
IDH	215	110	55	158	357	415	126,7	310	2,44	0,129	64,5
HIF1[math]\displaystyle{ \alpha }[/math]	57	58	57	564	570	565	57,3	566,3	9,88	7,2 x [math]\displaystyle{ 10^{-6} }[/math]	0,036

t-Test

Der t-Test wird verwendet, um zu bestimmen, ob die Mittelwerte zweier Stichproben sich signifikant voneinander unterscheiden. Dafür wird die Nullhypothese H0 getestet, sie sagt aus, dass Stichprobe und Kontrolle sich nicht signifikant unterscheiden. In diesem Fall also [math]\displaystyle{ H_0: \overline{X} Kontrolle = \overline{X}-NAT8L }[/math]

Die Gegenhypothese H1 sagt aus, dass sich die Ergebnisse signifikant unterscheiden, also

[math]\displaystyle{ H_1: \overline{X} Kontrolle \ne \overline{X}-NAT8L }[/math]
Mit Hilfe des t-Tests wird bestimmt, ob die Nullhypothese zutrifft, oder ob sie verworfen wird und die Gegenhypothese angenommen wird. Die Formel für den t-Test entspricht:
[math]\displaystyle{ t = \frac{\overline{X}_{1} - \overline{X}_{2} }{s_{x} \cdot \surd \frac{1}{n_{1}} + \frac{1}{n_{2}}} }[/math]

Parameter:

• [math]\displaystyle{ \overline{X}_1 }[/math] = Mittelwert Stichprobe 1
  
• [math]\displaystyle{ \overline{X}_2 }[/math] = Mittelwert Stichprobe 2
  
• [math]\displaystyle{ s_x }[/math] = Standardabweichung
• n = Größe der Stichprobe