8 Galaxy

From Bioinformatik Wiki
Revision as of 16:59, 4 October 2020 by Pge (talk | contribs)

Diese Vorlesung stellt eine praktische Übung im Umgang mit der Platform Galaxy dar.

Galaxy ist eine Open Source Software, die sogenannte 'Workflows' zur Verfügung stellt. Es richtet sich dabei an Forscher, die wenig praktische Erfahrung in der Bioinformatik haben, aber trotzdem die Vorteile der modernen Datenanalyse nutzen wollen. Dabei können Daten direkt in die Platform geladen werden und der Benutzer wird mittel eines virtuellen Assistenzsystems durch die notwendigen Tools geguidet.

Zum Nachlesen: https://de.wikipedia.org/wiki/Galaxy_(Bioinformatik)

Den Umgang lernt man dabei am Besten im "Learning by doing" Verfahren. Zum Benutzen von Galaxy sollte am Besten ein Account erstellt werden.

Zu Galaxy geht es hier:

https://usegalaxy.org

Die entsprechende Übung kann hier nachvollzogen werden: 8.Galaxy

Ansonsten ist es hilfreich einfach mal 'usegalaxy tutorials' auf einem separaten Bildschirm laufen zu lassen und das Programm simultan zu bedienen.

Ein Beispiel dafür wäre: https://www.youtube.com/watch?v=6kEX1_17raY

(PS: genießt den Akzent und die Hintergrundmusik)