8.Galaxy
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1. ENA
Informiere dich auf der Website des European Nucleotide Archive (ENA) über die Studie PRJEB22670.
a: Welche Art der Sequenzierung wurde bei der Studie durchgeführt? Welcher Zelltyp wurde analysiert?
Single cell RNA-Sequenzierung von LPS und Palmitat-stimulierten THP1 Makrophagen.
b: Welches Referenzgenom würdest du für ein späteres Alignment verwenden und wieso? Ein Humangenom, da menschliche Zellen.
c: Es wurde eine paired-end Sequenzierung durchgeführt. Was ist der Unterschied zur single