3 Alignments
From Bioinformatik Wiki
Auf dieser Seite sind die Themen zusammengeführt, die in Vorlesung 3 am 25.04.2019 behandelt wurden.
Alignments
→ Für ein Alignment werden spezielle Algorithmen benötigt.
Sequenz Alignments
- Ähnlichkeit quantitativ bestimmbar
- Erkennung ähnlicher Domänen
- erfordert das Einfügen von "gaps"
Globales Alignment
- alle Symbole werden berücksichtigt
- Vergleich ähnlicher Sequenzen mit ähnlicher Länge
Beispiel:
H | A | U | S | K | L | A | U | S | ||
↓ | ||||||||||
H | - | A | U | S | - | H | A | U | S | |
K | L | A | U | S | K | L | A | U | S | |
Score 8 | Score 8 |
Bewertungsschema: S