3 Alignments: Difference between revisions
From Bioinformatik Wiki
No edit summary |
No edit summary |
||
| Line 13: | Line 13: | ||
* alle Symbole werden berücksichtigt | * alle Symbole werden berücksichtigt | ||
* Vergleich ähnlicher Sequenzen mit ähnlicher Länge | * Vergleich ähnlicher Sequenzen mit ähnlicher Länge | ||
<br> | |||
Beispiel:<br> | |||
{| style="text-align: center" | |||
|- | |||
| H|| A|| U|| S|| || K|| L|| A|| U|| S|| | |||
|- | |||
| colspan="10" | ↓ | |||
|- | |||
| H|| -|| A|| U|| S|| || -|| H|| A|| U|| S | |||
|- | |||
| K|| L || A|| U|| S|| || K|| L|| A|| U|| S | |||
|- | |||
| colspan="5"| Score 8|| || colspan="5"| Score 8 | |||
|} | |||
Revision as of 20:05, 12 May 2019
Auf dieser Seite sind die Themen zusammengeführt, die in Vorlesung 3 am 25.04.2019 behandelt wurden.
Alignments
→ Für ein Alignment werden spezielle Algorithmen benötigt.
Sequenz Alignments
- Ähnlichkeit quantitativ bestimmbar
- Erkennung ähnlicher Domänen
- erfordert das Einfügen von "gaps"
Globales Alignment
- alle Symbole werden berücksichtigt
- Vergleich ähnlicher Sequenzen mit ähnlicher Länge
Beispiel:
| H | A | U | S | K | L | A | U | S | ||
| ↓ | ||||||||||
| H | - | A | U | S | - | H | A | U | S | |
| K | L | A | U | S | K | L | A | U | S | |
| Score 8 | Score 8 | |||||||||
