8 Galaxy: Difference between revisions
No edit summary |
No edit summary |
||
| Line 1: | Line 1: | ||
Diese Vorlesung stellt eine praktische Übung im Umgang mit der | Diese Vorlesung stellt eine praktische Übung im Umgang mit der Plattform Galaxy dar. | ||
Galaxy ist eine Open Source Software, die sogenannte 'Workflows' zur Verfügung stellt. Es richtet sich dabei an Forscher, die wenig praktische Erfahrung in der Bioinformatik haben, aber trotzdem die Vorteile der modernen Datenanalyse nutzen wollen. Dabei können Daten direkt in die | Galaxy ist eine Open Source Software, die sogenannte 'Workflows' zur Verfügung stellt. Es richtet sich dabei an Forscher, die wenig praktische Erfahrung in der Bioinformatik haben, aber trotzdem die Vorteile der modernen Datenanalyse nutzen wollen. Dabei können Daten direkt in die Plattform geladen werden und der Benutzer wird mittel eines virtuellen Assistenzsystems durch die notwendigen Tools geguided. | ||
Zum Nachlesen: | Zum Nachlesen: | ||
Latest revision as of 15:45, 31 January 2021
Diese Vorlesung stellt eine praktische Übung im Umgang mit der Plattform Galaxy dar.
Galaxy ist eine Open Source Software, die sogenannte 'Workflows' zur Verfügung stellt. Es richtet sich dabei an Forscher, die wenig praktische Erfahrung in der Bioinformatik haben, aber trotzdem die Vorteile der modernen Datenanalyse nutzen wollen. Dabei können Daten direkt in die Plattform geladen werden und der Benutzer wird mittel eines virtuellen Assistenzsystems durch die notwendigen Tools geguided.
Zum Nachlesen: https://de.wikipedia.org/wiki/Galaxy_(Bioinformatik)
Den Umgang lernt man dabei am Besten im "Learning by doing" Verfahren. Zum Benutzen von Galaxy sollte am Besten ein Account erstellt werden.
Zu Galaxy geht es hier:
https://usegalaxy.org
Die entsprechende Übung kann hier nachvollzogen werden: 8.Galaxy
Ansonsten ist es hilfreich einfach mal 'usegalaxy tutorials' auf einem separaten Bildschirm laufen zu lassen und das Programm simultan zu bedienen.
Ein Beispiel dafür wäre: https://www.youtube.com/watch?v=6kEX1_17raY
(PS: genießt den Akzent und die Hintergrundmusik)
