5 Transkriptom RNA Seq 2: Difference between revisions

From Bioinformatik Wiki
(Created page with "Auf dieser Seite sind die Themen zusammengeführt, die in Vorlesung 5 am 09.05.2019 behandelt wurden.")
 
No edit summary
Line 1: Line 1:
Auf dieser Seite sind die Themen zusammengeführt, die in Vorlesung 5 am 09.05.2019 behandelt wurden.
Auf dieser Seite sind die Themen zusammengeführt, die in Vorlesung 5 am 09.05.2019 behandelt wurden.
= RNAseq =
<br>
1. Isolierung von mRNA
* nur 1-2% der totalen RNA ist mRNA
* 90% rRNA
** poly(A) Anreicherung
** Abbau von rRNA
<br>
<br>
2. cDNA Synthese und Library Präparation
*Information über kodierenden Strang kann durch 2-stufige cDNA Synthese und dUTP Nukleotiden konserviert werden.
<br>
<big>
{|
|-
| A|| U|| G|| U|| C|| G|| A|| &nbsp;||mRNA
|-
| T|| A|| C|| A|| G|| C|| U|| &nbsp;||1. cDNA Strang
|-
| T|| A|| C|| A|| G|| C|| U|| &nbsp;||
|-
| A|| U|| G|| U|| C|| G|| A|| &nbsp;||2. cDNA Strang mit dUTPs statt dTTPs
|-
|}
</big>

Revision as of 00:21, 16 May 2019

Auf dieser Seite sind die Themen zusammengeführt, die in Vorlesung 5 am 09.05.2019 behandelt wurden.

RNAseq


1. Isolierung von mRNA

  • nur 1-2% der totalen RNA ist mRNA
  • 90% rRNA
    • poly(A) Anreicherung
    • Abbau von rRNA



2. cDNA Synthese und Library Präparation

  • Information über kodierenden Strang kann durch 2-stufige cDNA Synthese und dUTP Nukleotiden konserviert werden.


A U G U C G A   mRNA
T A C A G C U   1. cDNA Strang
T A C A G C U  
A U G U C G A   2. cDNA Strang mit dUTPs statt dTTPs