3 Alignments: Difference between revisions
From Bioinformatik Wiki
No edit summary |
No edit summary |
||
| Line 27: | Line 27: | ||
| colspan="5"| Score 8|| || colspan="5"| Score 8 | | colspan="5"| Score 8|| || colspan="5"| Score 8 | ||
|} | |} | ||
<br> | |||
<br> | |||
Bewertungsschema: S | |||
== Lokales Alignment == | == Lokales Alignment == | ||
Revision as of 19:20, 12 May 2019
Auf dieser Seite sind die Themen zusammengeführt, die in Vorlesung 3 am 25.04.2019 behandelt wurden.
Alignments
→ Für ein Alignment werden spezielle Algorithmen benötigt.
Sequenz Alignments
- Ähnlichkeit quantitativ bestimmbar
- Erkennung ähnlicher Domänen
- erfordert das Einfügen von "gaps"
Globales Alignment
- alle Symbole werden berücksichtigt
- Vergleich ähnlicher Sequenzen mit ähnlicher Länge
Beispiel:
| H | A | U | S | K | L | A | U | S | ||
| ↓ | ||||||||||
| H | - | A | U | S | - | H | A | U | S | |
| K | L | A | U | S | K | L | A | U | S | |
| Score 8 | Score 8 | |||||||||
Bewertungsschema: S
