Datenbanken: Difference between revisions
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'''[https://www.ebi.ac.uk/training-beta/online/courses/bioinformatics-terrified/what-makes-a-good-bioinformatics-database/primary-and-secondary-databases/ Primäre und Sekundäre Datenbanken]''' | |||
Datenbanken sind Systeme in denen Daten verwaltet und dauerhaft gespeichert werden. Im Zuge der Vorlesung wird zwischen primären und sekundären Datenbanken unterschieden: | Datenbanken sind Systeme in denen Daten verwaltet und dauerhaft gespeichert werden. Im Zuge der Vorlesung wird zwischen primären und sekundären Datenbanken unterschieden: | ||
'''Primäre Datenbanken''' enthalten experimentell ermittelte Daten, die als Rohdaten von Forschern zur Verfügung gestellt werden (archival database) z.B. [https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/ ArrayExpress], [https://www.uniprot.org/ UniProt-Swissprot], [https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home/ ENA], [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/ Genbank] und [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ NCBI GEO] angeführt. | |||
'''Sekundäre Datenbanken''' eenthalten hingegen abgeleitete oder vorhergesagte Daten, die das Ergebnis von Analysen und Literaturrecherchen sind. Es handelt sich hierbei oft um interpretierte Daten aus primären Datenbanken (curated database; knowledgebase) z.B. [https://www.uniprot.org/ UniProt-TrEMBL] oder [https://www.ebi.ac.uk/gxa/home/ Expression Atlas]. | |||
Revision as of 19:12, 28 January 2021
Primäre und Sekundäre Datenbanken
Datenbanken sind Systeme in denen Daten verwaltet und dauerhaft gespeichert werden. Im Zuge der Vorlesung wird zwischen primären und sekundären Datenbanken unterschieden:
Primäre Datenbanken enthalten experimentell ermittelte Daten, die als Rohdaten von Forschern zur Verfügung gestellt werden (archival database) z.B. ArrayExpress, UniProt-Swissprot, ENA, Genbank und NCBI GEO angeführt.
Sekundäre Datenbanken eenthalten hingegen abgeleitete oder vorhergesagte Daten, die das Ergebnis von Analysen und Literaturrecherchen sind. Es handelt sich hierbei oft um interpretierte Daten aus primären Datenbanken (curated database; knowledgebase) z.B. UniProt-TrEMBL oder Expression Atlas.
