11 BLAST II: Difference between revisions

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== Bewertung von BLAST Ergebnissen ==
== Bewertung von BLAST Ergebnissen ==
Score 'S'  
Score 'S'  
 
      L  A  S V  -  E            BLOSUM62 gap penalty = -4   
S =  
      L  T  S  L  A  Q
 
S = +4  0 +4 +1 -4 +2 = '''7'''
 
Zum Nachlesen von 'E-value' ist das FAQ der BLAST Domain hilfreich: What is the Expect (E) value?
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=FAQ#expect

Revision as of 01:45, 5 October 2020

Protein - Protein - BLAST: Liefert eher Ergebnisse, die im Hinblick auf Funktionsebene interessant sind

Dabei wird stets ein E-value zusammen mit dem Ergebnis rausgegeben. Dieses liefert einen Hinweis auf zufälliges Hintergrundrauschen der Suche. Je niedriger de E-value, desto signifikanter ist das Suchergebnis.

Bewertung von BLAST Ergebnissen

Score 'S'

     L  A  S  V  -  E            BLOSUM62 gap penalty = -4     
     L  T  S  L  A  Q
S = +4  0 +4 +1 -4 +2 = 7