4 Burrows-Wheeler: Difference between revisions

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= Burrows-Wheeler Indizierung =
Problem: lokale Alignments stoßen bei Genomsuchen an ihre Grenzen.
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Die Burrowa-Wheeler Indizierung dient zur Positionsbestimmung einer Sequenz.
* Ursprünglich zur Optimierung von Datenkompression entwickelt
* eignet sich auch zur effizienten Suche großer Texte/Sequenzen
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<big>Transformation: T= ACAACG</big>
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Revision as of 23:44, 15 May 2019

Auf dieser Seite sind die Themen zusammengeführt, die in Vorlesung 4 am 02.05.2019 behandelt wurden.

Burrows-Wheeler Indizierung

Problem: lokale Alignments stoßen bei Genomsuchen an ihre Grenzen.
Die Burrowa-Wheeler Indizierung dient zur Positionsbestimmung einer Sequenz.

  • Ursprünglich zur Optimierung von Datenkompression entwickelt
  • eignet sich auch zur effizienten Suche großer Texte/Sequenzen



Transformation: T= ACAACG