Datenbanken - Revision history

Mka at 18:21, 28 January 2021

2021-01-28T18:21:59Z

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	'''Sekundäre Datenbanken''' eenthalten hingegen abgeleitete oder vorhergesagte Daten, die das Ergebnis von Analysen und Literaturrecherchen sind. Es handelt sich hierbei oft um interpretierte Daten aus primären Datenbanken (curated database; knowledgebase) z.B. [https://www.uniprot.org/ UniProt-TrEMBL] oder [https://www.ebi.ac.uk/gxa/home/ Expression Atlas].		'''Sekundäre Datenbanken''' eenthalten hingegen abgeleitete oder vorhergesagte Daten, die das Ergebnis von Analysen und Literaturrecherchen sind. Es handelt sich hierbei oft um interpretierte Daten aus primären Datenbanken (curated database; knowledgebase) z.B. [https://www.uniprot.org/ UniProt-TrEMBL] oder [https://www.ebi.ac.uk/gxa/home/ Expression Atlas].


			'''Datenbanken'''
			<dl>
			Transkriptom Datenbanken
			<dd>- https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/
			<dd>- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
			<dd>- https://www.ebi.ac.uk/gxa/home</dd>
			Protein Datenbanken
			<dd>- https://www.uniprot.org/</dd>
			Genom Datenbanken
			<dd>- https://www.ebi.ac.uk/genomes/
			<dd>- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/</dd>
			</dl>

Mka at 18:12, 28 January 2021

2021-01-28T18:12:21Z

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			'''[https://www.ebi.ac.uk/training-beta/online/courses/bioinformatics-terrified/what-makes-a-good-bioinformatics-database/primary-and-secondary-databases/ Primäre und Sekundäre Datenbanken]'''

	Datenbanken sind Systeme in denen Daten verwaltet und dauerhaft gespeichert werden. Im Zuge der Vorlesung wird zwischen primären und sekundären Datenbanken unterschieden:		Datenbanken sind Systeme in denen Daten verwaltet und dauerhaft gespeichert werden. Im Zuge der Vorlesung wird zwischen primären und sekundären Datenbanken unterschieden:

	~~primäre~~ Datenbanken enthalten ~~Genom oder RNA-Sequenzen~~, als ~~Beispiel wurden hierfür~~ [https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/ ~~EBI~~ ArrayExpress] und [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ NCBI GEO] angeführt.		'''Primäre Datenbanken''' enthalten experimentell ermittelte Daten, die als Rohdaten von Forschern zur Verfügung gestellt werden (archival database) z.B. [https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/ ArrayExpress], [https://www.uniprot.org/ UniProt-Swissprot], [https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home/ ENA], [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/ Genbank] und [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ NCBI GEO] angeführt.

	~~sekundäre~~ Datenbanken ~~enthalten~~ abgeleitete ~~und verlinkten~~ Daten, ~~also gefilterte Datensätze, vergleichende oder vorhergesagt~~ Daten. ~~Ein Beispiel hierfür ist~~ [https://www.uniprot.org/ UniProt] oder [https://www.~~ncbi~~.~~nlm~~.~~nih.gov~~/~~refseq~~/ ~~NCBI RefSeq~~].		'''Sekundäre Datenbanken''' eenthalten hingegen abgeleitete oder vorhergesagte Daten, die das Ergebnis von Analysen und Literaturrecherchen sind. Es handelt sich hierbei oft um interpretierte Daten aus primären Datenbanken (curated database; knowledgebase) z.B. [https://www.uniprot.org/ UniProt-TrEMBL] oder [https://www.ebi.ac.uk/gxa/home/ Expression Atlas].

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Datenbanken sind Systeme in denen Daten verwaltet und dauerhaft gespeichert werden. Im Zuge der Vorlesung wird zwischen primären und sekundären Datenbanken unterschieden:

primäre Datenbanken enthalten Genom oder RNA-Sequenzen, als Beispiel wurden hierfür [https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/ EBI ArrayExpress] und [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ NCBI GEO] angeführt.

sekundäre Datenbanken enthalten abgeleitete und verlinkten Daten, also gefilterte Datensätze, vergleichende oder vorhergesagt Daten. Ein Beispiel hierfür ist [https://www.uniprot.org/ UniProt] oder [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/ NCBI RefSeq].