http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/api.php?action=feedcontributions&feedformat=atom&user=Christian-Alexander+Dudek 2026-05-28T20:51:33Z User contributions MediaWiki 1.39.7 http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=User:Christian-Alexander_Dudek&diff=672 2021-01-29T15:28:39Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>{|<br /> |-<br /> |<br /> = Dr. Christian-Alexander Dudek =<br /> <br /> Institute of Microbiology<br /> <br /> Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS)<br /> <br /> Technische Universität Braunschweig<br /> <br /> Rebenring 56<br /> <br /> 38106 Braunschweig<br /> <br /> Email: c.dudek@tu-bs.de<br /> <br /> Tel.: +49 531 391 55290<br /> <br /> http://bibc.tu-braunschweig.de<br /> <br /> http://www.brics.de<br /> ||<br /> [[File:Photo dudek.jpg|thumb]]<br /> |}</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=User:Christian-Alexander_Dudek&diff=671 2021-01-29T15:27:17Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>{|<br /> |-<br /> |<br /> '''Dr. Christian-Alexander Dudek'''<br /> <br /> Institute of Microbiology<br /> Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS)<br /> Technische Universität Braunschweig<br /> <br /> Rebenring 56<br /> 38106 Braunschweig<br /> <br /> Email: c.dudek@tu-bs.de<br /> Tel.: +49 531 391 55290<br /> <br /> http://bibc.tu-braunschweig.de<br /> http://www.brics.de<br /> <br /> ||<br /> [[File:Photo dudek.jpg|thumb]]<br /> |}</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=File:Photo_dudek.jpg&diff=670 2021-01-29T15:24:37Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div></div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=277 2019-11-12T07:02:03Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> Übersicht [[SS2019|SS2019]]<br /> <br /> [[Vorlesung 1]] | [[Vorlesung 2]] | [[Vorlesung 3]] | [[Vorlesung 4]] | [[Vorlesung 5]] | [[Vorlesung 6]] | [[Vorlesung 7]] | [[Vorlesung 8]] | [[Vorlesung 9]] | [[Vorlesung 10]] | [[Vorlesung 11]]<br /> <br /> [[Übung 1]] | [[Übung 2]] | [[Übung 3]] | [[Übung 4]] | [[Übung 5]] | [[Übung 6]] | [[Übung 7]] | [[Übung 8 ]] | [[Übung 9]] | [[Übung 10]] | [[Übung 11]]<br /> <br /> [[Glossar]]<br /> <br /> == Ansprechpartner ==<br /> Prof. Dr. Karsten Hiller (karsten.hiller@tu-braunschweig.de)<br /> <br /> Wiki Technik:<br /> * [[User:Nko|Nils Koschnitzki]]<br /> <br /> Inhalt:<br /> * [[User:Vero|Veronika Martin]]<br /> * [[User:Patrick Melichar|Patrick Melichar]]<br /> * [[User:L.motzko‎|Lukas Motzko]]<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=User:Christian-Alexander_Dudek&diff=276 2019-11-12T06:29:30Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>Christian-Alexander Dudek, M.Sc.<br /> <br /> Technische Universität Braunschweig<br /> <br /> Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS)<br /> <br /> Institute of Microbiology<br /> <br /> Rebenring 56<br /> 38106 Braunschweig<br /> <br /> Email: c.dudek@tu-bs.de<br /> Tel.: +49 531 391 55290<br /> <br /> http://bibc.tu-braunschweig.de<br /> http://www.brics.de</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=196 2019-09-24T06:15:36Z

<p>Christian-Alexander Dudek: /* Ansprechpartner */</p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> Übersicht [[SS2019|SS2019]]<br /> <br /> [[Vorlesung 1]] | [[Vorlesung 2]] | [[Vorlesung 3]] | [[Vorlesung 4]] | [[Vorlesung 5]] | [[Vorlesung 6]] | [[Vorlesung 7]] | [[Vorlesung 8]] | [[Vorlesung 9]] | [[Vorlesung 10]] | [[Vorlesung 11]]<br /> <br /> [[Übung 1]] | [[Übung 2]] | [[Übung 3]] | [[Übung 4]] | [[Übung 5]] | [[Übung 6]] | [[Übung 7]] | [[Übung 8 ]] | [[Übung 9]] | [[Übung 10]] | [[Übung 11]]<br /> <br /> [[Glossar]]<br /> <br /> <br /> == Ansprechpartner ==<br /> Prof. Dr. Karsten Hiller (karsten.hiller@tu-braunschweig.de)<br /> <br /> Wiki Technik:<br /> * [[User:Nko|Nils Koschnitzki]]<br /> <br /> Inhalt:<br /> * [[User:Vero|Veronika Martin]]<br /> * [[User:Patrick Melichar|Patrick Melichar]]<br /> * [[User:L.motzko‎|Lukas Motzko]]<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=195 2019-09-23T12:03:59Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> Übersicht [[SS2019|SS2019]]<br /> <br /> [[Vorlesung 1]] | [[Vorlesung 2]] | [[Vorlesung 3]] | [[Vorlesung 4]] | [[Vorlesung 5]] | [[Vorlesung 6]] | [[Vorlesung 7]] | [[Vorlesung 8]] | [[Vorlesung 9]] | [[Vorlesung 10]] | [[Vorlesung 11]]<br /> <br /> [[Übung 1]] | [[Übung 2]] | [[Übung 3]] | [[Übung 4]] | [[Übung 5]] | [[Übung 6]] | [[Übung 7]] | [[Übung 8 ]] | [[Übung 9]] | [[Übung 10]] | [[Übung 11]]<br /> <br /> [[Glossar]]<br /> <br /> <br /> == Ansprechpartner ==<br /> Wiki Technik:<br /> * [[User:Nko|Nils Koschnitzki]]<br /> Inhalt:<br /> * [[User:Vero|Veronika Martin]]<br /> * [[User:Patrick Melichar|Patrick Melichar]]<br /> * [[User:L.motzko‎|Lukas Motzko]]<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=165 2019-06-07T05:58:50Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> Übersicht [[SS2019|SS2019]]<br /> <br /> [[Vorlesung 1]] | [[Vorlesung 2]] | [[Vorlesung 3]] | [[Vorlesung 4]] | [[Vorlesung 5]] | [[Vorlesung 6]] | [[Vorlesung 7]] | [[Vorlesung 8]] | [[Vorlesung 9]] | [[Vorlesung 10]] | [[Vorlesung 11]]<br /> <br /> [[Übung 1]] | [[Übung 2]] | [[Übung 3]] | [[Übung 4]] | [[Übung 5]] | [[Übung 6]] | [[Übung 7]] | [[Übung 8 ]] | [[Übung 9]] | [[Übung 10]] | [[Übung 11]]<br /> <br /> [[Glossar]]<br /> <br /> <br /> == Ansprechpartner ==<br /> Wiki Technik und Verwaltung:<br /> * [[User:Christian-Alexander Dudek|Christian-Alexander Dudek]]<br /> Inhalt:<br /> * [[User:Vero|Veronika Martin]]<br /> * [[User:Patrick Melichar|Patrick Melichar]]<br /> * [[User:L.motzko‎|Lukas Motzko]]<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Talk:2_Transkriptom_RNA_Seq_1&diff=59 2019-05-06T08:53:47Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>Ist die Formel korrekt? Bitte erklärt auch die Parameter &lt;math&gt;P&lt;/math&gt; und &lt;math&gt;c&lt;/math&gt;--[[User:Christian-Alexander Dudek|Christian-Alexander Dudek, M.Sc. ]] ([[User talk:Christian-Alexander Dudek|talk]]) 10:53, 6 May 2019 (CEST)</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Talk:2_Transkriptom_RNA_Seq_1&diff=58 2019-05-06T08:44:35Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Created page with &quot;Ist die Formel korrekt? --~~~~&quot;</p> <hr /> <div>Ist die Formel korrekt?<br /> --[[User:Christian-Alexander Dudek|Christian-Alexander Dudek, M.Sc. ]] ([[User talk:Christian-Alexander Dudek|talk]]) 10:44, 6 May 2019 (CEST)</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=2_Transkriptom_RNA_Seq_1&diff=57 2019-05-06T08:37:10Z

<p>Christian-Alexander Dudek: /* FASTQ */</p> <hr /> <div><br /> Auf dieser Seite sind die Themen zusammengeführt, die in Vorlesung 2 am 18.04.2019 behandelt wurden.<br /> <br /> == Biologische Fragestellung ==<br /> Da NAT8L in euren Prostatakarzinomzellen erhöht exprimiert ist, habt ihr euch entschlossen die Genexpression durch RNAi (RNA Interferenz) zu silencen.<br /> <br /> == Experiment ==<br /> <br /> *insert pic here*<br /> <br /> == Sanger Methode ==<br /> Als Wiederholung:&lt;br&gt;<br /> <br /> [[File:Didesoxy-Methode.svg|400px][https://de.wikipedia.org/wiki/DNA-Sequenzierung#Didesoxymethode_nach_Sanger]]<br /> <br /> <br /> <br /> == '''N'''ext '''G'''eneration '''S'''equencing (NGS) ==<br /> === Illumina Sequencing (2nd Generation Sequencing) ===<br /> <br /> &lt;&lt;insert Beschreibung here&gt;&gt;<br /> <br /> Ergebnis der Illumina Sequenzierung:<br /> * Länge der reads 50-600bp<br /> * Fehlerrate ca. 0,1%<br /> * humanes Genom kann 30x am Tag sequenziert werden<br /> * Daten werden in FASTQ Format geliefert<br /> <br /> <br /> == FASTQ ==<br /> Eine FASTQ-Datei ist folgendermaßen aufgebaut: &lt;/br&gt;<br /> <br /> &lt;big&gt;<br /> <br /> @identifier # Sequenz identifier<br /> GATCTT # Sequenz<br /> + optionale Beschreibung<br /> !'CC'*+*!? # Qualität für jedes Level (Zahlenwert repräsentiert durch [https://de.wikipedia.org/wiki/American_Standard_Code_for_Information_Interchange#ASCII-Tabelle ASCII Tabelle] <br /> &lt;/big&gt;<br /> &lt;/br&gt;<br /> <br /> === Problem ===<br /> Viele kurze reads, die in einen Zusammenhang gebracht werden müssen!<br /> <br /> == Sequenzabdeckung ==<br /> G: Länge der Genomsequenz &lt;/br&gt;<br /> N: Anzahl der reads &lt;/br&gt;<br /> L: durchschnittliche Länge der reads &lt;/br&gt;<br /> c: Coverage (Abdeckung) &lt;/br&gt;<br /> &lt;/br&gt;<br /> «insert Formel hier»<br /> <br /> == Lander-Waterman-Modell ==<br /> Mathematisches Modell zur Errechnung, durch Sequenzierung, nicht abgedeckter Basenpaare.&lt;/br&gt;<br /> <br /> &lt;big&gt;<br /> P&lt;sub&gt;[nicht abgedecktes Bp]&lt;/sub&gt; = e&lt;sup&gt;&lt;big&gt;-c&lt;/big&gt;&lt;/sup&gt;<br /> &lt;/big&gt;<br /> &lt;/br&gt;<br /> <br /> Beispiele:&lt;/br&gt;<br /> c=10 → 1 Gap in 22000 Bp&lt;/br&gt;<br /> c=22 → 1 Gap in 3,6*10&lt;sup&gt;9&lt;/sup&gt; Bp&lt;/br&gt;<br /> <br /> &lt;big&gt;(c meist bei 30)&lt;/big&gt;<br /> <br /> == Assemblierung der reads ==<br /> <br /> &lt;big&gt;<br /> {|<br /> |-<br /> | -A || -C || -C || -T || -G || -A || -C || -T || -A || -G || -C || -T || -G || -A || -T || -C || -A || -A || -G || -G || -|| -|| Template<br /> |-<br /> | || || || || || || || || || || || || -G || -A || -T || -C || -A || -A || || || || || ||<br /> |-<br /> | || || || || || || || || -A|| -G|| -C|| -T|| -G|| -A|| || || || || || || || || || || ||<br /> |-<br /> | || || || || || -A|| -C|| &lt;span style=&quot;color:#00F; border-style: solid; border-width: 2px; margin: 2px&quot;&gt; G&lt;/span&gt;|| -A|| -G|| -C|| -T|| || || || || || || || || -|| -|| Punktmutation<br /> |-<br /> | || || || || || || || || || || || || -G|| -A|| -_|| -C|| -A|| -A|| -G|| -G|| -||-|| Deletion<br /> |}&lt;/big&gt;&lt;/br&gt;</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=39 2019-04-26T12:19:17Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> Übersicht [[SS2019|SS2019]]<br /> <br /> [[Vorlesung 1]] | [[Vorlesung 2]] | [[Vorlesung 3]]<br /> <br /> [[Übung 1]] | [[Übung 2]] <br /> <br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=SS2019&diff=38 2019-04-26T12:18:03Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>== Vorlesung ==<br /> Ab 11.04.2019&lt;br&gt;<br /> wöchentlich donnerstags, 16:45-18:15 Uhr<br /> <br /> Raum:PK11.3<br /> <br /> = Übungen =<br /> Die Übung findet dienstags um 8 Uhr bzw. mittwochs um 10 Uhr im Pool Raum im BRICS statt. Bei zu vielen Teilnehmenden wird die Übung bei bedarf in zwei Gruppen aufgeteilt.<br /> <br /> = Hinweise =<br /> * [[Vorgaben_Hausuafgaben|Vorgaben für Hausaufgaben]]<br /> * [[RocketChat|Rocketchat]]<br /> <br /> = Themen =<br /> * [[Biologisches problem|Biologisches problem]]<br /> * [[Microarrays|Microarrays]] &amp; [[RNASeq|RNASeq]]<br /> * ...</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=SS2019:Vorgaben_Hausuafgaben&diff=37 2019-04-26T12:17:30Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Christian-Alexander Dudek moved page SS2019:Vorgaben Hausuafgaben to Vorgaben Hausuafgaben over redirect</p> <hr /> <div>#REDIRECT [[Vorgaben Hausuafgaben]]</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Vorgaben_Hausuafgaben&diff=36 2019-04-26T12:17:30Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Christian-Alexander Dudek moved page SS2019:Vorgaben Hausuafgaben to Vorgaben Hausuafgaben over redirect</p> <hr /> <div>= Vorgaben für die Hausaufgabenabgabe =<br /> * Die Übung findet dienstags um 8 Uhr bzw. mittwochs um 10 Uhr statt.<br /> * Insgesamt 50% der Punkte aller Hausaufgaben müssen erreicht werden, insgesamt müssen von allen Zetteln mindestens 9 Zettel abgegeben worden sein.<br /> * Bei der Übung sollen die Studierenden die Aufgaben vorstellen. Dabei sollen diese sich in eine Liste eintragen, die von den Tutoren ausgehändigt wird. Die Studierenden sollen sich bei 50% der Aufgaben (falls eine Aufgabe nicht verstanden wurde) in der Liste als „vorstellbereit“ eintragen, die Tutoren suchen sich von der Liste die Vortragenden für die jeweilige Aufgabe zufällig aus.<br /> * Hausaufgaben werden während/nach der Vorlesung ausgeteilt und müssen spätestens bis zur nächsten Vorlesung auf stud.ip hochgeladen worden sein (Datum steht oben auf dem Hausaufgabenzettel).<br /> * Die Rückgabe erfolgt elektronisch über stud.ip im .pdf-Format, ggf. Zeichnungen werden eingescannt und in die .pdf eingefügt.. Es gibt für jede Hausaufgabe einen Ordner, der für die jeweilige Hausaufgabe gedacht ist. In diese Ordner wird die Hausaufgabe jeweils hochgeladen.<br /> <br /> Die Einsicht der Punkte erfolgt über stud.ip, Identifizierung über ein Pseudonym, der über ein Tool generiert wird. Der Link lautet: http://134.169.106.84/genid/<br /> <br /> Bei der Dateibenennung der Hausaufgaben bitte Nummer des Übungszettels und Pseudonym verwenden<br /> <br /> Beispiel: '''uebung01_agrobacterium_tumefaciens.pdf'''<br /> <br /> Auf die Übungszettel bitte nicht den Namen, sondern nur das Pseudonym aufschreiben, damit die Abgabe anonym erfolgt.<br /> <br /> * Bestehen des Moduls nur bei erfolgreich bestandenen Hausaufgaben.<br /> * Bei Fragen: In der Übung, die direkt auf die Vorlesung folgt, besteht immer die Möglichkeit, Fragen zum ausgegebenen Übungszettel zu stellen. Zusätzlich: Kommunikation über RocketChat, dies ist ein ChatProgramm das über die TU Braunschweig läuft. Zur Anleitung siehe unten. Hierbei soll sich z.B. auch untereinander geholfen werden können. <br /> * Bei der Feststellung eines Plagiats gilt die Hausaufgabe als nicht bestanden!</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=SS2019&diff=35 2019-04-26T12:16:38Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>== Vorlesung ==<br /> Ab 11.04.2019&lt;br&gt;<br /> wöchentlich donnerstags, 16:45-18:15 Uhr<br /> <br /> Raum:PK11.3<br /> <br /> = Übungen =<br /> Die Übung findet dienstags um 8 Uhr bzw. mittwochs um 10 Uhr im Pool Raum im BRICS statt. Bei zu vielen Teilnehmenden wird die Übung bei bedarf in zwei Gruppen aufgeteilt.<br /> <br /> = Hinweise =<br /> * [[SS2019:Vorgaben_Hausuafgaben|Vorgaben für Hausaufgaben]]<br /> * [[SS2019:RocketChat|Rocketchat]]<br /> <br /> = Themen =<br /> * [[SS2019:Biologisches problem|Biologisches problem]]<br /> * [[SS2019:Microarrays|Microarrays]] &amp; [[SS2019:RNASeq|RNASeq]]<br /> * ...</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=SS2019:Main_Page&diff=34 2019-04-26T12:16:03Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Christian-Alexander Dudek moved page SS2019:Main Page to SS2019</p> <hr /> <div>#REDIRECT [[SS2019]]</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=SS2019&diff=33 2019-04-26T12:16:03Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Christian-Alexander Dudek moved page SS2019:Main Page to SS2019</p> <hr /> <div>= Vorlesung =<br /> Ab 11.04.2019<br /> <br /> == Heading text ==<br /> [[Test]]<br /> <br /> wöchentlich donnerstags, 16:45-18:15 Uhr<br /> <br /> Raum:PK11.3<br /> <br /> = Übungen =<br /> Die Übung findet dienstags um 8 Uhr bzw. mittwochs um 10 Uhr im Pool Raum im BRICS statt. Bei zu vielen Teilnehmenden wird die Übung bei bedarf in zwei Gruppen aufgeteilt.<br /> <br /> = Hinweise =<br /> * [[SS2019:Vorgaben_Hausuafgaben|Vorgaben für Hausaufgaben]]<br /> * [[SS2019:RocketChat|Rocketchat]]<br /> <br /> = Themen =<br /> * [[SS2019:Biologisches problem|Biologisches problem]]<br /> * [[SS2019:Microarrays|Microarrays]] &amp; [[SS2019:RNASeq|RNASeq]]<br /> * ...</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=32 2019-04-26T12:15:46Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> [[SS2019|SS2019]]<br /> <br /> <br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=MediaWiki:Common.css&diff=31 2019-04-26T12:14:28Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>/* CSS placed here will be applied to all skins */<br /> .color-left {<br /> background-color: #be1c3d;<br /> }<br /> .color-middle {<br /> background-color: #005042;<br /> }<br /> .color-right {<br /> background-color: #006f97;<br /> }</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=MediaWiki:Common.css&diff=30 2019-04-26T12:13:31Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>/* CSS placed here will be applied to all skins */<br /> .color-left {<br /> background-color: #fff;<br /> }<br /> .color-middle {<br /> background-color: #fff;<br /> }<br /> .color-right {<br /> background-color: #fff;<br /> }</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=MediaWiki:Common.css&diff=29 2019-04-26T12:12:37Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>/* CSS placed here will be applied to all skins */<br /> body {<br /> background-color: #fff;<br /> }</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=MediaWiki:Common.css&diff=28 2019-04-26T12:12:26Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Created page with &quot;/* CSS placed here will be applied to all skins */ body { background-color: #f0f; }&quot;</p> <hr /> <div>/* CSS placed here will be applied to all skins */<br /> body {<br /> background-color: #f0f;<br /> }</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=27 2019-04-26T11:03:30Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> [[SS2019:Main_Page|SS2019]]<br /> <br /> &lt;math&gt;e=mc^2&lt;/math&gt;<br /> <br /> &lt;gallery&gt;<br /> Example.jpg|Caption1<br /> Example.jpg|Caption2<br /> Example.jpg|Caption2<br /> Example.jpg|Caption2<br /> Example.jpg|Caption2<br /> &lt;/gallery&gt;<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=26 2019-04-26T11:03:15Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> [[SS2019:Main_Page|SS2019]]<br /> &lt;math&gt;e=mc^2&lt;/math&gt;<br /> &lt;gallery&gt;<br /> Example.jpg|Caption1<br /> Example.jpg|Caption2<br /> Example.jpg|Caption2<br /> Example.jpg|Caption2<br /> Example.jpg|Caption2<br /> &lt;/gallery&gt;<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=File:Figure1a.png&diff=24 2019-04-26T09:26:15Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div></div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=23 2019-04-26T08:49:19Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> [[SS2019:Main_Page|SS2019]]<br /> <br /> &lt;gallery&gt;<br /> Example.jpg|Caption1<br /> Example.jpg|Caption2<br /> Example.jpg|Caption2<br /> Example.jpg|Caption2<br /> Example.jpg|Caption2<br /> &lt;/gallery&gt;<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=22 2019-04-26T08:48:36Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> [[SS2019:Main_Page|SS2019]]<br /> <br /> [[File:Figure1a.png]]<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=21 2019-04-26T08:47:11Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> [[SS2019:Main_Page|SS2019]]<br /> <br /> [[File:Figure1a.png|200px|thumb|left|alt text]]<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=RNASeq&diff=20 2019-04-26T08:38:02Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Created page with &quot;= RNASeq =&quot;</p> <hr /> <div>= RNASeq =</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=SS2019:Biologisches_problem&diff=19 2019-04-26T08:37:49Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Vorlesung 1 =<br /> Datum: xxxx&lt;br&gt;<br /> Thema: Kevin&lt;br&gt;<br /> <br /> == Biologisches Problem ==<br /> <br /> == Microarray ==<br /> <br /> == [[RNASeq]] ==</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=SS2019:Biologisches_problem&diff=18 2019-04-26T08:37:12Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Created page with &quot;= Vorlesung 1 = Datum: xxxx&lt;br&gt; Thema: Kevin&lt;br&gt; == Biologisches Problem == == Microarray == == RNASeq ==&quot;</p> <hr /> <div>= Vorlesung 1 =<br /> Datum: xxxx&lt;br&gt;<br /> Thema: Kevin&lt;br&gt;<br /> <br /> == Biologisches Problem ==<br /> <br /> == Microarray ==<br /> <br /> == RNASeq ==</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Test&diff=17 2019-04-26T08:07:40Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>v xfsdfsdf</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Test&diff=16 2019-04-26T08:06:37Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Created page with &quot; v xfsdfsdf&quot;</p> <hr /> <div> v xfsdfsdf</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=SS2019&diff=15 2019-04-26T08:06:27Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Vorlesung =<br /> Ab 11.04.2019<br /> <br /> == Heading text ==<br /> [[Test]]<br /> <br /> wöchentlich donnerstags, 16:45-18:15 Uhr<br /> <br /> Raum:PK11.3<br /> <br /> = Übungen =<br /> Die Übung findet dienstags um 8 Uhr bzw. mittwochs um 10 Uhr im Pool Raum im BRICS statt. Bei zu vielen Teilnehmenden wird die Übung bei bedarf in zwei Gruppen aufgeteilt.<br /> <br /> = Hinweise =<br /> * [[SS2019:Vorgaben_Hausuafgaben|Vorgaben für Hausaufgaben]]<br /> * [[SS2019:RocketChat|Rocketchat]]<br /> <br /> = Themen =<br /> * [[SS2019:Biologisches problem|Biologisches problem]]<br /> * [[SS2019:Microarrays|Microarrays]] &amp; [[SS2019:RNASeq|RNASeq]]<br /> * ...</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=SS2019:RocketChat&diff=14 2019-04-24T12:54:04Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Christian-Alexander Dudek moved page SS2019:RocketChat to RocketChat over redirect</p> <hr /> <div>#REDIRECT [[RocketChat]]</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=RocketChat&diff=13 2019-04-24T12:54:04Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Christian-Alexander Dudek moved page SS2019:RocketChat to RocketChat over redirect</p> <hr /> <div>= RocketChat =<br /> Dazu wird entweder im Browser unter http://messenger.tu-braunschweig.de oder in der App „RocketChat“ das Programm RocketChat aufgerufen. Die Anmeldung erfolgt mit der y-Nummer (ohne @tu-bs.de!) und dem Passwort, das auch für die Anmeldung auf der TUBS-Website benutzt wird. Um in die Gruppe einzutreten, sucht nach „BioinformatikUebungSS19“ und betretet die Gruppe. Nun solltet ihr Beiträge schreiben und lesen können. Über den Browser können noch ein paar mehr Einstellungen vernommen werden, als über die App, wie z.B. Push-Benachrichtigungen etc.<br /> <br /> Falls Fragen zu RocketChat auftreten oder ihr Probleme bei der Einrichtung habt, schreibt uns eine E-Mail an bioinfo-lehre@tu-bs.de.<br /> <br /> == Hinweise Android ==<br /> Auf Android Smartphones können zur Zeit keinen Gruppen beigetreten werden. Android Nutzer müssen einmalig im [http://messenger.tu-braunschweig.de Webinterface] nach der Gruppe suchen und dort beitreten. Im Anschluss kann die Gruppe auch über die Android-App genutzt werden.</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=12 2019-04-24T09:53:29Z

<p>Christian-Alexander Dudek: </p> <hr /> <div>= Aktuelles Semester (SS2019) =<br /> [[SS2019:Main_Page|SS2019]]<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=User:Christian-Alexander_Dudek&diff=11 2019-04-24T09:52:55Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Created page with &quot;Christian-Alexander Dudek, M.Sc. Technische Universität Braunschweig Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS) Department of Bioinformatics and Biochemistry...&quot;</p> <hr /> <div>Christian-Alexander Dudek, M.Sc.<br /> <br /> Technische Universität Braunschweig<br /> Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS)<br /> Department of Bioinformatics and Biochemistry<br /> Rebenring 56<br /> 38106 Braunschweig<br /> <br /> Email: c.dudek@tu-bs.de<br /> Tel.: +49 531 391 55162<br /> <br /> http://bibc.tu-braunschweig.de<br /> http://www.brics.de</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Vorgaben_Hausuafgaben&diff=8 2019-04-24T09:43:49Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Christian-Alexander Dudek moved page Vorgaben Hausuafgaben to SS2019:Vorgaben Hausuafgaben</p> <hr /> <div>= Vorgaben für die Hausaufgabenabgabe =<br /> * Die Übung findet dienstags um 8 Uhr bzw. mittwochs um 10 Uhr statt.<br /> * Insgesamt 50% der Punkte aller Hausaufgaben müssen erreicht werden, insgesamt müssen von allen Zetteln mindestens 9 Zettel abgegeben worden sein.<br /> * Bei der Übung sollen die Studierenden die Aufgaben vorstellen. Dabei sollen diese sich in eine Liste eintragen, die von den Tutoren ausgehändigt wird. Die Studierenden sollen sich bei 50% der Aufgaben (falls eine Aufgabe nicht verstanden wurde) in der Liste als „vorstellbereit“ eintragen, die Tutoren suchen sich von der Liste die Vortragenden für die jeweilige Aufgabe zufällig aus.<br /> * Hausaufgaben werden während/nach der Vorlesung ausgeteilt und müssen spätestens bis zur nächsten Vorlesung auf stud.ip hochgeladen worden sein (Datum steht oben auf dem Hausaufgabenzettel).<br /> * Die Rückgabe erfolgt elektronisch über stud.ip im .pdf-Format, ggf. Zeichnungen werden eingescannt und in die .pdf eingefügt.. Es gibt für jede Hausaufgabe einen Ordner, der für die jeweilige Hausaufgabe gedacht ist. In diese Ordner wird die Hausaufgabe jeweils hochgeladen.<br /> <br /> Die Einsicht der Punkte erfolgt über stud.ip, Identifizierung über ein Pseudonym, der über ein Tool generiert wird. Der Link lautet: http://134.169.106.84/genid/<br /> <br /> Bei der Dateibenennung der Hausaufgaben bitte Nummer des Übungszettels und Pseudonym verwenden<br /> <br /> Beispiel: '''uebung01_agrobacterium_tumefaciens.pdf'''<br /> <br /> Auf die Übungszettel bitte nicht den Namen, sondern nur das Pseudonym aufschreiben, damit die Abgabe anonym erfolgt.<br /> <br /> * Bestehen des Moduls nur bei erfolgreich bestandenen Hausaufgaben.<br /> * Bei Fragen: In der Übung, die direkt auf die Vorlesung folgt, besteht immer die Möglichkeit, Fragen zum ausgegebenen Übungszettel zu stellen. Zusätzlich: Kommunikation über RocketChat, dies ist ein ChatProgramm das über die TU Braunschweig läuft. Zur Anleitung siehe unten. Hierbei soll sich z.B. auch untereinander geholfen werden können. <br /> * Bei der Feststellung eines Plagiats gilt die Hausaufgabe als nicht bestanden!</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=SS2019&diff=7 2019-04-24T09:43:32Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Created page with &quot;= Vorlesung = Ab 11.04.2019 wöchentlich donnerstags, 16:45-18:15 Uhr Raum:PK11.3 = Übungen = Die Übung findet dienstags um 8 Uhr bzw. mittwochs um 10 Uhr im Pool Raum im...&quot;</p> <hr /> <div>= Vorlesung =<br /> Ab 11.04.2019<br /> <br /> wöchentlich donnerstags, 16:45-18:15 Uhr<br /> <br /> Raum:PK11.3<br /> <br /> = Übungen =<br /> Die Übung findet dienstags um 8 Uhr bzw. mittwochs um 10 Uhr im Pool Raum im BRICS statt. Bei zu vielen Teilnehmenden wird die Übung bei bedarf in zwei Gruppen aufgeteilt.<br /> <br /> = Hinweise =<br /> * [[SS2019:Vorgaben_Hausuafgaben|Vorgaben für Hausaufgaben]]<br /> * [[SS2019:RocketChat|Rocketchat]]<br /> <br /> = Themen =<br /> * [[SS2019:Biologisches problem|Biologisches problem]]<br /> * [[SS2019:Microarrays|Microarrays]] &amp; [[SS2019:RNASeq|RNASeq]]<br /> * ...</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=RocketChat&diff=5 2019-04-24T09:40:32Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Christian-Alexander Dudek moved page RocketChat to SS2019:RocketChat</p> <hr /> <div>= RocketChat =<br /> Dazu wird entweder im Browser unter http://messenger.tu-braunschweig.de oder in der App „RocketChat“ das Programm RocketChat aufgerufen. Die Anmeldung erfolgt mit der y-Nummer (ohne @tu-bs.de!) und dem Passwort, das auch für die Anmeldung auf der TUBS-Website benutzt wird. Um in die Gruppe einzutreten, sucht nach „BioinformatikUebungSS19“ und betretet die Gruppe. Nun solltet ihr Beiträge schreiben und lesen können. Über den Browser können noch ein paar mehr Einstellungen vernommen werden, als über die App, wie z.B. Push-Benachrichtigungen etc.<br /> <br /> Falls Fragen zu RocketChat auftreten oder ihr Probleme bei der Einrichtung habt, schreibt uns eine E-Mail an bioinfo-lehre@tu-bs.de.<br /> <br /> == Hinweise Android ==<br /> Auf Android Smartphones können zur Zeit keinen Gruppen beigetreten werden. Android Nutzer müssen einmalig im [http://messenger.tu-braunschweig.de Webinterface] nach der Gruppe suchen und dort beitreten. Im Anschluss kann die Gruppe auch über die Android-App genutzt werden.</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=RocketChat&diff=4 2019-04-24T09:39:45Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Created page with &quot;= RocketChat = Dazu wird entweder im Browser unter http://messenger.tu-braunschweig.de oder in der App „RocketChat“ das Programm RocketChat aufgerufen. Die Anmeldung erfol...&quot;</p> <hr /> <div>= RocketChat =<br /> Dazu wird entweder im Browser unter http://messenger.tu-braunschweig.de oder in der App „RocketChat“ das Programm RocketChat aufgerufen. Die Anmeldung erfolgt mit der y-Nummer (ohne @tu-bs.de!) und dem Passwort, das auch für die Anmeldung auf der TUBS-Website benutzt wird. Um in die Gruppe einzutreten, sucht nach „BioinformatikUebungSS19“ und betretet die Gruppe. Nun solltet ihr Beiträge schreiben und lesen können. Über den Browser können noch ein paar mehr Einstellungen vernommen werden, als über die App, wie z.B. Push-Benachrichtigungen etc.<br /> <br /> Falls Fragen zu RocketChat auftreten oder ihr Probleme bei der Einrichtung habt, schreibt uns eine E-Mail an bioinfo-lehre@tu-bs.de.<br /> <br /> == Hinweise Android ==<br /> Auf Android Smartphones können zur Zeit keinen Gruppen beigetreten werden. Android Nutzer müssen einmalig im [http://messenger.tu-braunschweig.de Webinterface] nach der Gruppe suchen und dort beitreten. Im Anschluss kann die Gruppe auch über die Android-App genutzt werden.</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Vorgaben_Hausuafgaben&diff=3 2019-04-24T09:35:59Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Created page with &quot;= Vorgaben für die Hausaufgabenabgabe = * Die Übung findet dienstags um 8 Uhr bzw. mittwochs um 10 Uhr statt. * Insgesamt 50% der Punkte aller Hausaufgaben müssen erreicht...&quot;</p> <hr /> <div>= Vorgaben für die Hausaufgabenabgabe =<br /> * Die Übung findet dienstags um 8 Uhr bzw. mittwochs um 10 Uhr statt.<br /> * Insgesamt 50% der Punkte aller Hausaufgaben müssen erreicht werden, insgesamt müssen von allen Zetteln mindestens 9 Zettel abgegeben worden sein.<br /> * Bei der Übung sollen die Studierenden die Aufgaben vorstellen. Dabei sollen diese sich in eine Liste eintragen, die von den Tutoren ausgehändigt wird. Die Studierenden sollen sich bei 50% der Aufgaben (falls eine Aufgabe nicht verstanden wurde) in der Liste als „vorstellbereit“ eintragen, die Tutoren suchen sich von der Liste die Vortragenden für die jeweilige Aufgabe zufällig aus.<br /> * Hausaufgaben werden während/nach der Vorlesung ausgeteilt und müssen spätestens bis zur nächsten Vorlesung auf stud.ip hochgeladen worden sein (Datum steht oben auf dem Hausaufgabenzettel).<br /> * Die Rückgabe erfolgt elektronisch über stud.ip im .pdf-Format, ggf. Zeichnungen werden eingescannt und in die .pdf eingefügt.. Es gibt für jede Hausaufgabe einen Ordner, der für die jeweilige Hausaufgabe gedacht ist. In diese Ordner wird die Hausaufgabe jeweils hochgeladen.<br /> <br /> Die Einsicht der Punkte erfolgt über stud.ip, Identifizierung über ein Pseudonym, der über ein Tool generiert wird. Der Link lautet: http://134.169.106.84/genid/<br /> <br /> Bei der Dateibenennung der Hausaufgaben bitte Nummer des Übungszettels und Pseudonym verwenden<br /> <br /> Beispiel: '''uebung01_agrobacterium_tumefaciens.pdf'''<br /> <br /> Auf die Übungszettel bitte nicht den Namen, sondern nur das Pseudonym aufschreiben, damit die Abgabe anonym erfolgt.<br /> <br /> * Bestehen des Moduls nur bei erfolgreich bestandenen Hausaufgaben.<br /> * Bei Fragen: In der Übung, die direkt auf die Vorlesung folgt, besteht immer die Möglichkeit, Fragen zum ausgegebenen Übungszettel zu stellen. Zusätzlich: Kommunikation über RocketChat, dies ist ein ChatProgramm das über die TU Braunschweig läuft. Zur Anleitung siehe unten. Hierbei soll sich z.B. auch untereinander geholfen werden können. <br /> * Bei der Feststellung eines Plagiats gilt die Hausaufgabe als nicht bestanden!</div>

Christian-Alexander Dudek http://wiki.bioinfo.nat.tu-bs.de/index.php?title=Main_Page&diff=2 2019-04-24T09:26:16Z

<p>Christian-Alexander Dudek: Adds current semester link</p> <hr /> <div>= Current semester (SS2019) =<br /> [[SS2019:Main_Page|SS2019]]<br /> <br /> == Semester Archive ==<br /> ''None''</div>

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